- Jurusan/Program Studi Manajemen sumberdaya Perairan
Jurnal Manajemen Sumber Daya Perairan : https://ojs.uho.ac.id/index.php/JMSP
- Jurusan/Program Studi Budidaya Perairan
Jurnal Media Akuatika (terakreditasi KEMENRISTEK DIKTI Sinta 5) :
https://ojs.uho.ac.id/index.php/JMA
- Jurusan/Program Studi Ilmu Kelautan
Jurnal Sapa Laut (terakreditasi KEMENRISTEK DIKTI Sinta 5) : https://ojs.uho.ac.id/index.php/JSL
- Jurusan/Program Studi Agribisnis Perikanan
Jurnal Bisnis Perikanan (Journal of Fishery Business) : https://ojs.uho.ac.id/index.php/bisnisperikanan
Jurnal Sosial Ekonomi Perikanan : https://ojs.uho.ac.id/index.php/JSEP/index
- Jurusan/Program Studi Teknologi Hasil Perikanan
Jurnal Fish Protech (JFP) (Journal of Fisheries Processing Technology) (terakreditasi KEMENRISTEK DIKTI Sinta 4) : https://ojs.uho.ac.id/index.php/jfp/index
- Program Studi Perikanan Tangkap
PekaBuana : Jurnal Ilmiah Teknologi dan Manajemen Perikanan Tangkap : https://ojs.uho.ac.id/index.php/pekabuana